「贖罪日禁食禱告會」共分三段舉行。第一段從早上10點至中午1點，由佳音教會、台北靈糧堂原住民牧區分別帶領敬拜。寇紹恩牧師在信息中，以基督之家教會這一年的更新增長，印證2008年真是轉化元年。剛由聖地參加特會回國的原住民教牧團隊，主領第一段的禱告，分別為台灣社會的人際、倫理、道德、心靈等四分面認罪，並為這四方面的轉化懇切禱告。
在禱告中，張以諾牧師特別安排了喜信會的荷蘭籍宣教士滿牧師接受原住民的致謝，感激荷蘭歸正教會於1624年至1662年間，共差派32位宣教士來台建立教會，並翻譯平埔族語聖經。夏忠堅牧師也代表漢民族向荷蘭人認罪，夏牧師哽咽地説：「鄭成平x隊及當時漢人移民所殺害荷蘭宣教士的血，在南台灣的土地裡有哀告的聲音，我們必須代表我們的祖先向荷蘭人認罪。」全場會眾哭泣認罪禱告，求上帝赦免流人血的罪。這項實際的認罪，成為「贖罪日」的具體行動。
第二段禱告由下午2點開始到5點，由全國禱告網絡負責帶領敬拜及禱告。「葛福臨福音節慶」禱告組組長劉玉霞牧師的信息及帶領禱告極為感人，她深入傳講「贖罪日」在新舊約中意義，並傳遞她所領受上帝對台灣的命定。她帶領會眾脱鞋、跪下，向上帝宣告要委身愛台灣，全體會眾也為台灣的藝術、科技、錢財、環境的轉化禱告。
第三段禱告則自晚上6點開始到10點，前半段由台北靈糧堂帶領敬拜，周神助牧師以「基督裡的新人」為主題，強調「贖罪日」也是「贖舊日」，需要贖回舊人作新造的人。之後，靈糧神學院謝宏忠院長帶領大家作悔改及先知性禱告，求聖靈破除台灣屬靈的轄制。後半段在台北榮耀堂團隊帶領敬拜之後，朱台深牧師與台北教會聯合會數位教牧同工，帶領會眾為台灣的政治、經濟、教育、傳播的轉化禱告。
「台北葛福臨福音節慶」總幹事夏忠堅牧師，在三段的禱告中也特別以剛出爐的「21天收割禱告手冊」及「福音節慶禱告刮刮卡」，帶領全體會眾為即將於十月底登場的「葛福臨福音節慶」懇切禱告。在禱告最後，夏牧師並呼召會眾將簽上各自姓名的「禱告火焰卡」，貼在「禱告火焰祭壇」上，表明決志為「福音節慶」守望禱告及獻身為失喪
