反對兩岸服務貿易協議抗議行動持續升高，為了迫使政府妥協，反對者不滿足佔領立法院，23日大批學生翻牆闖入行政院，與駐院警員發生肢體衝突。
為阻情勢惡化，行政院長江宜樺下令警方強制驅離，經過警方五波強制驅離、水柱驅散後，最後一批學生在清晨5點多離開行政院。
台北警政署長王卓鈞清晨趕赴行政院，表示闖入行政院完全是違法行為，警方採取驅離方式是依法行事。他還説強佔行政院的人未必都是學生。
據台北市衞生局表示，23日晚至24日上午9時30分共收治107名抗議活動傷患，僅1人住院，沒有啟動大量傷患機制。
警方強制驅散抗議民眾後，台灣長老教會今天上午發表「譴責國家暴力，追求和平公義」聲明，幾位牧者前往醫院探視受傷學生。
雖然行政院強調驅散措施是依法行事，但長老會聲明中將所有責任推卸給馬英九政府，批評當局「沒有真誠地傾聽民意，只一心一意要學習中國的獨裁恐怖統治，用殘暴的手段攻擊在行政院的民眾，並恐嚇在立法院四周參與這次學運的學生與民眾。這種行為已經背離民意，違反民主及漠視人權。」
聲明還為學生運動辯護説，「學生以和平的方法越過行政院前拒馬與警力，進入行政院後並沒有大破壞，反而是以靜坐的方式，表達『愛與非暴力』的行動原則。」
除了譴責暴力，聲明也祈求台灣能在「愛與非暴力」的原則之下，使公義與和平落實。同時要求馬江出面，為破壞民主體制、使用國家暴力向人民道歉，並退回黑箱服貿、維護民主體制。
台灣長老會與南部的神學院都對「反黑箱服貿」抗議活動表達支持。23日，台灣公義行動教會在立法院正門口舉行主日禮拜，鼓勵信徒參與。
然而，並非所有教會都對反服貿抗議活動表明立場，更多的台灣教會更傾向於保持沉默。但在網上，不少基督徒都對長老教會高調的政治立場表達質疑。
一些網友表示長老教會的聲明不代表全體台灣教會，還指其背後動機充滿政治色彩，也不認同抗議者的激進行為，希望大家禱告求主給執政者智慧和平處理服貿爭議，以愛代替仇恨，不再有人受傷。
台灣基督徒藝人陳建州在臉數也對抗議失控事件表示關心。他説，「今晚真的讓人非常、非常的難過……願上帝保佑台灣！」
