反对两岸服务贸易协议抗议行动持续升高，为了迫使政府妥协，反对者不满足占领立法院，23日大批学生翻墙闯入行政院，与驻院警员发生肢体冲突。
为阻情势恶化，行政院长江宜桦下令警方强制驱离，经过警方五波强制驱离、水柱驱散后，最后一批学生在清晨5点多离开行政院。
台北警政署长王卓钧清晨赶赴行政院，表示闯入行政院完全是违法行为，警方采取驱离方式是依法行事。他还说强占行政院的人未必都是学生。
据台北市卫生局表示，23日晚至24日上午9时30分共收治107名抗议活动伤患，仅1人住院，没有启动大量伤患机制。
警方强制驱散抗议民众后，台湾长老教会今天上午发表"谴责国家暴力，追求和平公义"声明，几位牧者前往医院探视受伤学生。
虽然行政院强调驱散措施是依法行事，但长老会声明中将所有责任推卸给马英九政府，批评当局"没有真诚地倾听民意，只一心一意要学习中国的独裁恐怖统治，用残暴的手段攻击在行政院的民众，并恐吓在立法院四周参与这次学运的学生与民众。这种行为已经背离民意，违反民主及漠视人权。"
声明还为学生运动辩护说，"学生以和平的方法越过行政院前拒马与警力，进入行政院后并没有大破坏，反而是以静坐的方式，表达『爱与非暴力』的行动原则。"
除了谴责暴力，声明也祈求台湾能在"爱与非暴力"的原则之下，使公义与和平落实。同时要求马江出面，为破坏民主体制、使用国家暴力向人民道歉，并退回黑箱服贸、维护民主体制。
台湾长老会与南部的神学院都对"反黑箱服贸"抗议活动表达支持。23日，台湾公义行动教会在立法院正门口举行主日礼拜，鼓励信徒参与。
然而，并非所有教会都对反服贸抗议活动表明立场，更多的台湾教会更倾向于保持沉默。但在网上，不少基督徒都对长老教会高调的政治立场表达质疑。
一些网友表示长老教会的声明不代表全体台湾教会，还指其背后动机充满政治色彩，也不认同抗议者的激进行为，希望大家祷告求主给执政者智慧和平处理服贸争议，以爱代替仇恨，不再有人受伤。
台湾基督徒艺人陈建州在脸数也对抗议失控事件表示关心。他说，"今晚真的让人非常、非常的难过……愿上帝保佑台湾！"
