台灣大學哲學系副教授柯志明反駁説，主張肛交正當化就是否定人體器官有特定的自然本性，否定人類能知道並判別器官的自然本性，「這都是一種誇大的強詞奪理，而毫無理性可言。」
柯教授解釋説，肛交的行為超越了器官的自然職能，是不合乎自然的，因為肛門不是為了性交，而是為了排糞便。
但同性戀主義者顛覆普通人的日常判斷力，狡辯説「自然的」其實很難定義，因為器官的職能具有多樣化，比如嘴巴可以説話、吃喝、唱歌，也可以親吻；手可以寫字、打球、用飯、敲打等。
雖然一些器官的職能確實是多樣的，但柯教授指出這不能否認器官有其特定的自然本性。「好比説，沒有手的人經練習後學會用腳寫字；但不能反過來説，因為腳能用來寫字，所以用腳寫字就是合乎腳之自然本性。」
「因此，一個器官『能』用來做什麼不表示這個器官做這個行為是『自然的』，因為『能』做什麼可以由意志決定，但器官的自然使用需合於器官的本性，即器官的存在目的；而器官的存在目的不是受人的意志決定的，而是與人體的其他器官有著整體的關係，人是在人體的活動機能中運用器官的特定職能。」他説。
醫學已經證明，不合乎器官本性地使用器官常帶來問題與疾病，例如男同性戀性愛行為——肛交容易產生、傳播愛滋病就是其中一例。
他還強調，只有極少數器官能被人的意志支配，而且在意志未介入器官時，人體整個器官仍然不斷運作以維持身體的存在。
「顯然，器官本來就有其先天的職能，展現這個職能的就是它的自然（本性）。所以『能』不等於『自然』。」柯教授説。
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