今年7月底，方濟乘專機從巴西返回梵蒂岡途中接受記者採訪首度談及同性戀話題。不過，他的言論遭一些媒體斷章取義，也被同性戀主義者擴大解讀，讓人誤以為教廷對同性戀的立場有所變化。
因此，方濟昨日的重新表態可看作是他對同性戀議題風波的澄清。方濟在訪談中坦承説，他的話因遭媒體的誤讀而遭受很大的壓力，但其實他的同性戀議題觀點與教會是一致的，這是不容置疑的。
如果説有什麼不同，他認為自己會更清楚的表明平衡、全面的聖經觀點。「在譴責同性戀性行為的同時，希望信徒帶著尊重、同情與憐憫的心去關愛同性戀者。」他説。
方濟期待天主教會對敏感議題不要一味的提出強硬立場，同時也要展現出温暖的一面，多包容那些陷入罪中之人。否則整體道德高塔可能如「一幢紙牌堆砌的房屋」應聲崩塌。
方濟在同性戀議題的態度比前任本篤教宗更為開明。他在巴西舉行的世界青年日上表示他不會論斷自稱是同性戀者的天主教神父。
他還説，「如果一個人是同性戀，尋求神且心地良善，我又怎能論斷他呢？他們不應該由於這種（傾向）而被邊緣化，他們必須融入主流。」
方濟還將同性性取向與性行為切割，強調這種性取向不是大問題，該譴責的是同性戀性愛及同性戀主義。
方濟這番言論受到温和天主教徒的歡迎，但有可能引發保守派的質疑。
方濟是天主教1,300年以來，第一位非歐洲籍教宗，也是首位來自拉丁美洲和出身耶穌會的教宗。
